Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms