Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD4Q5VX71 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD4Q5VX71 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms