Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOCADQ5VW36 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms