Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms