Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms