Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF3Q5SZQ8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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