Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms