Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms