Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms