Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms