Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms