Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms