Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms