Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms