Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDRF1Q3B7T1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDRF1Q3B7T1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms