Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNAXIP1Q2TAA8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNAXIP1Q2TAA8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms