Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM1Q2NKQ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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