Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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