Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM187BQ17R55 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms