Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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