Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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