Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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