Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms