Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms