Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SF1Q15637 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms