Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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SS18Q15532 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SS18Q15532 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SS18Q15532 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SS18Q15532 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SS18Q15532 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SS18Q15532 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SS18Q15532 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SS18Q15532 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SS18Q15532 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SS18Q15532 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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