Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SYCP1Q15431 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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