Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.948e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 510.15□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RNF220-216ENST00000488865 860 ntTSL 223.79■■□□□ 1.48e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-214ENST00000464902 1851 ntTSL 219.85■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-218ENST00000476713 562 ntTSL 213.04□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-215ENST00000468301 534 ntTSL 411.68□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-217ENST00000475533 971 ntTSL 511.1□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ZFAND2B-220ENST00000489197 855 ntTSL 39.09□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RNF220-206ENST00000453863 361 ntTSL 38.34□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.7□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 LAMTOR5-AS1-238ENST00000626572 1044 ntTSL 54.99□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ARRB1-210ENST00000532525 925 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-12■■■■■ 32
SF3B4Q15427 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 515.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 STAT2-208ENST00000557156 539 ntTSL 47.03□□□□□ -1.286e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.84■■□□□ 1.571e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUZ12P1-206ENST00000582557 1560 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-10■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-10■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-207ENST00000509320 1872 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RRP1-206ENST00000492638 1017 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-215ENST00000557203 524 ntTSL 413.2□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 GSTA4-203ENST00000370963 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 32
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SF3B4Q15427 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 GSTA4-204ENST00000457564 379 ntTSL 210.7□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-209ENST00000513337 565 ntTSL 410.44□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 LENG8-AS1-203ENST00000448978 464 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 GSTA4-205ENST00000477599 1127 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 PCBP2-216ENST00000550192 734 ntTSL 49.15□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 GSTA4-202ENST00000370960 859 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 47.48□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ORC2-204ENST00000464147 2185 ntTSL 57.42□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-16■■■■■ 32
SF3B4Q15427 CNNM3-204ENST00000480035 396 ntTSL 55.02□□□□□ -1.612e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-208ENST00000478396 797 ntTSL 54.92□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 24.49□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-204ENST00000420397 983 ntTSL 54.46□□□□□ -1.74e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 CCNL1-206ENST00000464679 534 ntTSL 34.32□□□□□ -1.722e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 44.25□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 TAF1D-213ENST00000529900 1066 ntTSL 24.08□□□□□ -1.763e-23■■■■■ 32
SF3B4Q15427 CCNL1-225ENST00000495471 772 ntTSL 24.05□□□□□ -1.763e-17■■■■■ 32
SF3B4Q15427 CCNL1-223ENST00000481173 571 ntTSL 23.44□□□□□ -1.863e-17■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 33.03□□□□□ -1.922e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 GSTA4-206ENST00000486559 1698 ntTSL 22.51□□□□□ -2.012e-9■■■■■ 32
SF3B4Q15427 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.074e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 513.88□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUGP2-204ENST00000593795 747 ntTSL 512.68□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 32
SF3B4Q15427 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 29.52□□□□□ -0.892e-11■■■■■ 32
SF3B4Q15427 B4GALT2-205ENST00000481924 1004 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-15■■■■■ 32
SF3B4Q15427 CTC1-205ENST00000578537 943 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 32
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