Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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