Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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