Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms