Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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