Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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