Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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