Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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