Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms