Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
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SHROOM2Q13796 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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SHROOM2Q13796 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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SHROOM2Q13796 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
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