Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms