Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXE3Q13461 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXE3Q13461 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXE3Q13461 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FOXE3Q13461 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXE3Q13461 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXE3Q13461 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXE3Q13461 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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