Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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