Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME3Q13232 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME3Q13232 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NME3Q13232 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME3Q13232 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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