Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2BQ13224 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2BQ13224 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
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