Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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