Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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