Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCRN3Q0VDG4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms