Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms