Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms