Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms