Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms