Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms